Справляется ли Израиль с пандемией?
Последний месяц различные российские интернет-ресурсы утверждают, что, несмотря на вакцинацию, Израиль якобы не справляется с новым штаммом дельта. Приводятся цифры вроде “11 из 16 госпитализированных — полностью привиты” или “из 80 госпитализированных 90% полностью привиты”.
Правда ли это? И если правда, то что означают эти цифры? Мы попросили биоинформатика Дмитрия Равчеева объяснить, почему само по себе число вакцинированных среди заболевших ни о чем не говорит, и о чем на самом деле говорят израильские данные.
Вступление: абстрактный пример про важность контекста.
Что не так с утверждением “11 из 16 госпитализированных — полностью привиты, значит, вакцины не работают”? Во-первых, такие материалы ссылаются на слова отдельных израильских врачей, а в одном, отдельно взятом госпитале вполне может быть 11 привитых из 16 тяжело больных — но из этого нельзя делать вывод о заболеваемости по стране в целом. Во-вторых, уловка кроется в интерпретации чисел: количество привитых среди заболевших — это абсолютные значения, вне контекста они никак не отражают эпидемиологическую обстановку. Контекстом в этом случае являются данные о количестве привитых и непривитых по стране в целом. И считать надо не число привитых среди заболевших, а долю заболевших, отдельно среди привитых и непривитых, и их соотношение.
Поясню на примере (Рис. 1): допустим, есть две разные группы людей, и в каждой из них больны, например, гриппом, ровно по 40 человек. Казалось бы, группы равнозначны — ведь больных в них поровну. Нет разницы, прививка не помогает? Неверно! Не хватает данных (вот она, уловка)! Например, если в первой группе 1 000 человек, а во второй — 200, то получится что в первой группе заболеваемость всего 4% (каждый двадцать пятый), а во второй — 20% (каждый пятый!). Поэтому важно смотреть на число заболевших относительно численности всей группы.
Израильские данные
Теперь обратимся к данным по Израилю в целом, которые, как будет видно ниже, сильно отличаются от данных по отдельному госпиталю, озвученных отдельным врачом. Данные можно найти на официальном сайте Министерства Здравоохранения Израиля.
Какие данные доступны?
- Распределение вакцинированных по возрасту и полу.
- Количество заболевших, госпитализированных и умерших от последствий Covid-19 за последний месяц, последние 3, 6 и 12 месяцев, а также за весь период пандемии.
- Еженедельное количество заразившихся, с разбивкой по возрастным группам, среди вакцинированных и невакцинированных. Данные о заразившихся вакцинированных разбиты на 8 групп, по 4 группы для привитых одной и двумя дозами: через 1–6, 7–13, 14–20 и более 20 дней после вакцинации.
К сожалению, данных о госпитализации и смертности среди вакцинированных на сайте нет (Пока готовился этот текст, такие данные появились, и они подтверждают приведенные в тексте выводы.)
По просьбе Рационально о коронавирусе я проанализировал доступные данные и далее расскажу о наиболее значимых, по моему мнению, наблюдениях.
Сколько вакцинированных среди заболевших?
В первом анализе использованы еженедельные данные по заболеваемости для периода с 20.12.2020 по 17.07.2021. Здесь стоит отметить следующие моменты:
1) Я считал число заболевших для категорий “вакцинированы 2 дозами” и “вакцинированы минимум одной дозой”. Вторая категория включает в себя первую (как следует из описания). Почему не посчитать для привитых только 1 дозой? Потому, что эта категория крайне изменчива, между первой и второй дозами проходит всего 4 недели — многие просто “не успевают заболеть”. Поэтому для привитых только 1 дозой показатели как правило низкие, и можно подумать, что 1 доза лучше, чем две, но это не так.
2) Цифры для вакцинированных несколько завышены, поскольку зачастую для них в исходной таблице указано “<5”, и, чтобы посчитать еженедельные значения или значения для разных возрастных групп, я брал максимальное значение, 5.
На Рис. 2 показано количество заболевших среди разных категорий граждан Израиля, на Рис. 3 — удельная, или относительная, заболеваемость (число заболевших в категории на общую численность категории).
Вспомним пример в начале с двумя группами из 1 000 и 200 человек, в каждой из которой 40 больных — только вот в случае вакцинации от коронавируса размеры групп еще все время меняются. В начале вакцинации привитых мало и большинство заболевших будут непривитыми. В настоящее время, когда в Израиле привито более половины популяции, процент привитых среди заболевших будет явно выше, чем, скажем, год назад, поэтому важно считать именно удельную заболеваемость. Какие же выводы можно сделать из этих графиков?
1) Последние два месяца, несмотря на штамм Дельта, и удельная, и общая заболеваемость коронавирусом в Израиле гораздо ниже, чем во вторую волну.
2) Количество привитых среди заболевших никак не дотягивает до “80%”, и, как я показал выше, надо считать удельную заболеваемость, а она ниже для привитых, чем для непривитых (на графике на Рис. 3 видно, что на отрезке июнь-июль 2021 года линии для привитых ниже).
Насколько в целом эффективна вакцинация для предотвращения заражения?
Я проанализировал данные для того же периода, с 20.12.2020 по 17.07.2021, на этот раз отдельно для разных возрастных групп. Краткие результаты представлены на Рис. 4. в виде таблицы. Из нее видно, что
1) Удельная заболеваемость растёт с возрастом во всех группах, что неудивительно. Коронавирус особо опасен для пожилых людей.
2) Удельная заболеваемость среди привитых гораздо ниже таковой среди непривитых, удельная заболеваемость среди привитых двумя дозами ниже, чем среди привитых минимум 1 дозой..
3) Вакцинация минимум одной дозой сокращает заболеваемость в 12–23 раз (среднее = 17 раз), а двумя дозами — в 33–159 раз (среднее = 72 раза).
А что же со штаммом Дельта? Насколько массовая вакцинация эффективна против него? Частично на этот вопрос я уже ответил в обсуждении графиков (Рис. 2–3). Хотя новый штамм “заразнее” предыдущих, заболеваемость в третью волну как минимум в 10 раз меньше, чем во вторую. Дополнительно подтвердить этот тезис можно, сравнив имеющиеся данные за последний месяц (июль 2021) с данными за последний год (с августа 2020 по июль 2021).
В таблице (Рис. 5) показаны абсолютные показатели для заболеваемости, госпитализации и смертности от последствий коронавируса — за последний месяц и среднемесячное за последний год (для этого суммарные годовые показатели поделили на 12).
Какие же выводы можно сделать?
1) Подтверждается уже известный факт: для пожилых коронавирус особо опасен. Хотя для молодых показатели заболеваемости выше, для пожилых куда выше показатели госпитализации и смертности.
2) Удельные показатели заболеваемости, госпитализации и смертности за последний месяц гораздо ниже, чем среднемесячные за год. И это несмотря на то, что новый штамм “заразнее” предыдущих. Так, месячная заболеваемость составляет 27% от годовой (меньше в 3.7 раз), госпитализация — 15% (меньше в 6.6 раз), а смертность — 6% (меньше в 17.1 раз).
Выводы
1. Израиль справляется с пандемией. Если бы не новый завезенный штамм дельта, то это была бы заявка на победу.
2. Вакцина защищает на индивидуальном уровне: вакцинация одной дозой снижает вероятность заражения в среднем в 17 раз, а двумя дозами — в среднем в 72 раза. Даже если привитый заболеет — у него меньше вероятность быть госпитализированным, чем у непривитого, и гораздо, гораздо меньше вероятность умереть.
3. Массовая вакцинация крайне выгодна обществу в целом — заболеваемость снижается как для привитых, так и для непривитых. Потому что вирусу сложно заражать привитых, а значит — сложно распространяться в популяции.
Дмитрий Равчеев, кандидат биологических наук, биоинформатик
Bioinformatic Researcher, MicroGen Biotech, Carlow, Ireland
Специально для телеграм канала https://t.me/coronavirus_facts
(альтернативная ссылка https://tele.gg/coronavirus_facts)
Использованные данные
[1] Данные о возрастной структуре Израиля: https://www.populationpyramid.net/israel/2021/
[2] Страница с данными по Covid-19, официальный сайт Министерства Здравоохранения Израиля: https://datadashboard.health.gov.il/COVID-19/general
[3] Еженедельные данные о заболевших среди разных возрастных групп вакцинированных и невакцинированных: https://data.gov.il/dataset/covid-19/resource/9b623a64-f7df-4d0c-9f57-09bd99a88880
[4] Предварительные расчеты доступны по ссылке https://docs.google.com/spreadsheets/d/1l48jIPjoKIEIXNgbA_qIOhDlfzbj4jLOcn8UiVVScAE
