Guia definitivo para organizar meu ambiente Python
Henrique Bastos
18814

Segui com seu tutorial e criei 3 envs para meus projetos nomeados: “jupyter3 (python3), ipython2 (python2), biotools3 (miniconda3) e biotools2 (miniconda2)”.

No jupyter3 instalei apenas o jupyter e ativei seu kernel, conforme seu tutorial. No ipython2 fiz o mesmo do tutorial. Nos biotools3 e biotools2, instalei ferramentas pelo conda relacionadas a cada versão do python.

Resumo… quando abro o notebook, escolho o kernel 2.7 e dou um “python — version”, visualizo como versão o Python 3.6.1. Da mesma forma, quando tento executar um dos scripts dos softwares do biotools2 por dentro do Notebook, visualizo a mensagem de erro abaixo:

File "/home/XXXXXXX/.pyenv/versions/miniconda2-latest/envs/biotools2/lib/python2.7/site-packages/qiime-1.9.1-py2.7.egg-info/scripts/print_qiime_config.py", line 40, in <module>
raise ImportError("%s\n%s" % (e, core_dependency_missing_msg))
ImportError: No module named ipykernel.pylab.backend_inline

Por fora do Jupyter Notebook, usando o pyenv, não vejo esse erro. Onde posso ter errado?

Desde já agradeço.

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