Acho que ainda não entendi o que estava acontecendo hehehe.

Você está chamando a MainActivity no click do botão OK do alertDialog? Pelo projeto, estamos chamando a MainActivity quando o usuário clica no loginButton. O único alertDialog que temos é quando o usuário não preenche um dos campos (login e/ou senha) e clica no loginButton, fora isso, não deveria aparecer nenhum alert, e o login deveria ser feito normalmente. Ou seja, a MainActivity deveria ser chamada.

Mas enfim, conseguiu resolver o problema? Se precisar de alguma ajuda só falar cara =D
Valeu aí!