Я пользуюсь Coinkeeper на Iphone и Ipad. Также заметил невозможность пользования приложением во время синхронизации при запуске приложения. Выглядит это примерно так: запускаешь приложение, оно открывается, но при этом ничего не реагирует на нажатии/перетаскивание примерно 2–3 секунды. Аналогичная ситуация происходит и разворачивании приложения, если до этого оно было свернуто. Если это невозможно убрать, то было бы неплохо, если пользователю как то сообщалось о том, что приложение синхронизируется(анимация какая-нибудь), а то создается впечатление, что приложение просто зависло.
P.S. Так же очень неприятная ситуация создается, когда блокируешь айфон, с открытым(не свернутым) приложением. При попытке разблокировки телефона, экран с вводом цифрового кода(телефона) остается на экране до тех пор, пока приложение не синхронизируется. Причем в это время создается впечатление, что твой Iphone завис, ибо при этом телефона ни на что не реагирует.