偶像歌手「未麻」轉型為演員後，不只恐嚇威脅不斷，還有人架設網站「未麻的部屋」，鉅細靡遺她的行程與心情。未麻內心早已困惑不安，拍完強暴劇碼和露點寫真後更逐漸迷失自我，而周遭接二連三的兇殺案，更讓未麻產生看見另一個自己的幻覺……
名義上為改編竹內義和的同名小說，《藍色恐懼》其實只留下原作的三大要素──偶像、恐怖、跟蹤狂。彈性的劇情給今敏發揮的自由，他在本片中以強烈美術和獨特剪輯，呈現未麻的混亂意識與因而迷離的主觀現實。沒有日本動畫界死抱的三元素「機器人、美少女、SF」，而且在預算不高的情況下，今敏卻拍出心理驚悚片（註 1）的最佳動畫範例，並奠定他虛實交融、多重敘事、懸疑驚悚，著重人物心理的鮮明風格。
未麻是偶像，是演員，也是會到超市買牛奶和魚飼料的普通女孩，剛開始她還能順利轉換角色，因此台上是台上，台下是台下，界限涇渭分明，觀眾得以分辨到哪兒是哪。然而，當環境和事件開始與未麻的願望牴觸 — — 強暴戲和露點寫真，再加上未麻演的戲與她本身或她的現實生活共鳴 — — 情緒崩潰、精神耗弱，還有連續殺人事件，她變得分不清戲劇、妄想／夢境，和現實之間的界限，場景間的轉換跟著越來越快，越來越意識流，觀眾只能被扯進這模稜兩可，虛實難辨的漩渦，甚至和未麻一樣，得依靠詭異的網站「未麻的部屋」來死命抓著「原來去了原宿啊」之類即使為假也沒關係的日常。
未麻究竟做了什麼、沒做過什麼？她殺了人嗎？未麻本身的混亂之外，還加上未麻的瘋狂粉絲 — — 「眼距過寬男」Me-Mania 的主觀敘事，哪些是他的妄想，哪些是真實？人是他殺的嗎？到底是誰殺了誰？
虛實交融和多重敘事產生不確定，不確定則營造出懸疑驚悚，但真正令我難以忍受的東西其實是那些確定、扎實，由「凝視」感受到的暴力。強暴一景中，未麻在舞台上被臨演圍困，舞台下有觀看的工作人員，攝影機從四面八方對準未麻，還有螢幕前的觀眾，一同眼睜睜看著未麻被壓制在地，聲嘶力竭、拚命掙扎，最終被侵犯，並且被一大堆眼睛看著自己被侵犯。鏡頭時而以未麻的視角，時而對準未麻，時而對準對準未麻的鏡頭，觀者一方面宛如置身未麻之恐怖處境，同時又被迫抽離，觀看她被施暴，成為施暴者一員。成語曰：「怵目驚心」、「卒不忍睹」，因為有時候「看」令人無法忍受。今敏在《千年女優》的訪談中曾說：「電影不是用看的，而是要用身體來體會。」《藍色恐懼》已用毫不手軟的視覺暴力和相得益彰的剪輯手法，成功做到這一點。
達倫・艾洛諾夫斯基（Darren Aronofsky）毫不諱言自己對《藍色恐懼》的喜愛，除了買下翻拍版權，在《噩夢輓歌》（Requiem for a Dream, 2000）中更使用完全相同的分鏡（註 2），而讓他家喻戶曉的《黑天鵝》（Black Swan, 2010）看來更是處處有《藍色恐懼》的影響……
2007年，《藍色恐懼》十週年，今敏替 NHK 拍了一分鐘短片《早安》（Ohayo）。
註 1：今敏在《藍色恐懼》講座中說，雖然知道一定會被這樣歸類，但他其實並沒有拍心理驚悚（psycho suspense）的打算，他想拍的是讓觀眾懷疑是給小孩子看的，結果其實是給大人看的。
註 2：達倫說是「致敬」，但今敏接受訪談曾表示「致敬」不是這樣用的。
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