Tú misma afirmas lo evidente: La broma asesina no va de Barbara Gordon, y eso NO tiene por qué ser malo.

Alan Moore buscaba contar una historia, y para ello necesitaba mostrar al lector que el Joker había cruzado una línea y estaba más demente que nunca, siendo el método escogido destrozar a un personaje ¿La razón de que sea Barbara y no Robin o Aflred? Que entonces no funcionaría.

Si mataran a Robin (cosa que TAMBIÉN HICIERON, y es una de las muertes más salvajes de la historia del cómic) no tendría el mismo efecto porque, sorpresa, el comisario Gordon no tiene una implicación emocional con él. No podría hacer la escena del parque, no tendría sentido que Gordon estuviese tan afectado por lo sucedido y sobre todo cuando Gordon dice “Demuéstrale que no estamos por encima de la ley” no tendría valor porque para Gordon solo sería un crío más.

Si mataran a Alfred tampoco tendría sentido porque 1) implicaría que Joker conoce la verdadera identidad de Batman y 2) Gordon no carece de una relación emocional con él.

“¿Y por qué no matan al hijo de Gordon?” dirá alguno. Bueno, fácil. ¿Cuantos de aquí conocen al hijo de Gordon y saben decir su nombre y algo que haya hecho previo 1986? ¿Y cuantos conocían y sabrían decir cosas de Bárbara en esa época?

Y si fuera un personaje random… pues una vez más, Gordon no tendría una implicación emocional con él (y el lector todavía menos).

No se trata de que Killing Joke maltrate a la mujer por el hecho de maltratarla

Se trata de que Killing Joke necesita maltratar a uno de sus personajes para contar la historia que buscaba y dio la casualidad de que el personaje que mejor encajaba en el guión buscado era una mujer.