Como calcular o índice de diversidade de Simpson no R
Em um outro post eu mostrei como calcular o Índice de Diversidade de Shannon, nesse nós vamos ver o Índice de Diversidade de Simpson.
Da mesma forma que no outro post, nós utilizaremos o pacote Vegan para os cálculos e banco de dados BCI (Se você não têm o pacote Vegan instalado, dê uma olhada na publicação anterior para mais detalhes).
Índice de Simpson
O índice de diversidade de Simpson (D) é calculado da seguinte maneira:
onde pi é a proporção de espécies i.
Por vezes, o índice pode ser encontrado da seguinte maneira (considerando uma comunidade finita):
onde ni é o número de indivíduos na espécie i, e N é o número total de indivíduos.
¹Magurran, A. E. (1988). “Ecological Diversity and Its Measurement.” Princeton University Press.
Calculando
No R:
De acordo com o Índice de Diversidade de Simpson, a parcela #20 foi a que possuiu um maior valor de diversidade, diferentemente do Índice de Shannon, que apontava a parcela #27. Já o menor valor ficou com a parcela #35, semelhante o Índice de Shannon.
A diferença entre os índices á esperada, uma vez que cada um possui um peso diferente para as espécies raras. O Índice de Shannon considera igual peso entre as espécies raras e abundantes. Então você deve considerar esses pesos na hora de decidir qual análises utilizar.
Até!
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