Como escrever resumos para área de bioinformática

Olá pessoal!! Hoje trazemos algumas dicas para auxiliá-los na hora de escrever resumos expandidos na área de bioinformática. Então se você decidiu submeter algum trabalho relacionado a bioinformática, te liga neste post!

1º Passo — Organizando suas ideias

Quando a gente realiza um trabalho científico são necessárias duas coisas de grande importância:

- Definir exatamente sobre o que você vai escrever;

- Ter certeza de que entendeu a questão a qual o trabalho gira em torno, bem como a importância de cada método adotado;

Para isso, existem algumas perguntas que você deve saber responder antes de começar a escrever seu resumo, alguns exemplos são:

1- O que foi estudado? Qual o objeto deste estudo? Quais são suas principais palavras-chave? (entendimento da questão abordada)

2- Porque você estudou isso? Qual a relevância desse estudo atualmente? Qual questão você quis resolver e como você se propôs a resolvê-la (passo a passo)? (metodologia)

3- Quais os resultados que você atingiu? Quais dados você gerou utilizando determinada metodologia? (resultados)

4- Quais dúvidas você conseguiu explicar? Quais novas questões surgiram? (discussões)

5- A que conclusões você chegou? E porque essas conclusões são importantes? A sua metodologia foi eficiente? (conclusões)

A partir do momento que tais perguntas estão respondidas seu resumo já tem uma estrutura consolidada e será necessário então apenas desenvolver as respostas.

2º Passo — Achando um bom título

O título é uma das partes mais importantes do seu trabalho, pois é o primeiro a ser lido. É a partir dele que seu trabalho se torna ou não interessante para leitura e apresentação.

Dar o título a um trabalho é uma das partes mais difíceis, mas ao mesmo tempo permite que você consiga ser criativo ao defini-lo. Você pode pensar nas questões respondidas no item anterior, focar nas palavras chaves que determinou e no objeto de estudo.

Por exemplo:

“Análises in silico de lectinas de Musa acuminata ssp. Malaccensis: uma abordagem estrutural”

Nesse título vemos:

A palavra-chave do público de interesse (análise in sílico) ou seja, de forma computacional o que se relaciona a área da bioinformática.

O objeto de estudo, lectinas pertencentes a espécie de Musa acuminata.

E em qual aspecto essas proteínas (lectinas) foram estudadas, ou seja, um estudo da parte estrutural.

O seu trabalho pode e deve ter palavras chaves diferentes das que aparecem no título algumas nesse resumo poderiam ser: Proteínas, Bioinformática, Alinhamento múltiplo.

3º Passo — Estruturando o resumo

O resumo deve abordar 4 pontos principais: 1) Introdução; 2) Metodologia; 3) Resultados e discussão; 4) Conclusões;

No caso de um resumo expandido é importante que você consiga em no máximo 4 ou 5 páginas (depende do limite estipulado pelo evento que você irá submeter) desenvolver todo o seu trabalho e deixar clara a linha de raciocínio empregada.

- Introdução

É importante que a sua introdução seja bastante completa para que seja possível mostrar alguns pontos essenciais como: o que se tem na literatura acerca do seu objeto de estudo e qual lacuna o seu trabalho vem a preencher, porque a bioinformática é uma ferramenta a ser utilizada para o estudo, qual foi o objetivo deste trabalho.

A minha sugestão é você dividir em 3 parágrafos:

1) O que se tem na literatura acerca do seu objeto de estudo?

2) Qual a lacuna em que o seu trabalho vem a se encaixar?

3) Porque utilizar a bioinformática e qual o objetivo?

Utilizarei como exemplo o meu resumo expandido relacionado ao título já mencionado.

Resposta à pergunta 1:

“Lectinas são um grupo de proteínas que possuem a capacidade de se ligar a carboidratos/glicoproteínas de forma reversível e seletiva, encontram-se amplamente distribuídas na natureza e participam de diversos processos biológicos. Podem ser divididas em famílias de acordo com suas características estruturais específicas (SINGH et al., 2004), como por exemplo, a estrutura tridimensional dos sítios de ligação, que se apresentam conservados a nível dos aminoácidos. A família das lectinas relacionadas a Jacalina engloba lectinas como a isolada do fruto de Musa acuminata, popularmente conhecida como banana. As lectinas do gênero Musa já demonstraram capacidade imunomoduladora, antiproliferativa, cicatrizante e antiviral (HOPPER et al., 2017; SWANSON et al., 2010).”

Resposta à pergunta 2:

“Ainda que a maioria dos estudos se concentre nas diferentes atividades biológicas da lectina de Musa acuminata, a Banlec, pouco se sabe sobre suas variantes estruturais (KENNEDY et al., 1995). A vasta diversidade estrutural e de especificidade está intimamente ligada as diferentes atividades biológicas das lectinas (DAMME et al., 1998). Ou seja, existem domínios de reconhecimento a carboidratos altamente conservados, que apresentam informações a respeito da funcionalidade dessas proteínas.”

Resposta à pergunta 3:

“A partir do surgimento de ferramentas de bioinformática cada vez mais precisas, houve um grande crescimento na quantidade de sequências disponíveis em bancos de dados. Isto possibilitou a elucidação de estruturas proteicas tridimensionais para análises estruturais e conformacionais, o que permite averiguar as diferentes configurações que modificam sua atividade (CHEN, 2015). Levando em consideração a falta de informações quanto as variantes estruturais das lectinas presentes na subespécie Malaccensis de Musa acuminata, o objetivo deste trabalho foi modelar e analisar as diferenças nos sítios de ligações a carboidratos destas proteínas, tendo em vista que mudanças pontuais nestes locais podem levar a alteração das atividades biológicas.”

- Metodologia, resultados e discussão

Para a metodologia, resultados e discussão você irá deixar reservado o maior número de folhas do seu resumo.

Normalmente em bioinformática a metodologia consiste em utilizar uma série de softwares para as análises necessárias ao trabalho, isto pode incluir bancos de dados para busca de sequências, programas de alinhamento, softwares de modelagem de proteínas, dentre outros. Desta forma, é interessante que você faça uma espécie de “linha do tempo” dos programas utilizados, assim é possível você seguir uma sequência lógica e organizar a ordem de escrita da sua metodologia citando qual o software utilizado e para o que.

Outro ponto importante é sempre referenciar os programas utilizados, além de descrever os parâmetros utilizados, além disso, em se tratando de proteínas e sequências é sempre importante colocar o devido código de identificação.

Abaixo uma parte da metodologia como exemplo:

“Com o objetivo de encontrar lectinas do gênero Musa, foi utilizado a ferramenta de BLAST para realizar o alinhamento local (BLASTp) das sequências de lectina de M. acuminata (AAM48480.1), obtidas no banco de dados do NCBI, levando em consideração os seguintes paramêtros: database de proteínas não redundantes (nr) e restringindo a organismos pertencentes a família Musaceae (ALTSCHUL et al., 1990). Foi utilizada a ferramenta CLUSTAL (BROWN et al., 2007) para fazer o alinhamento global das sequências que tiveram as maiores identidades na etapa anterior a fim de identificar diferenças e semelhanças globais entre elas.”

Percebam a cronologia — Obtive a sequência proteica no banco de dados do NCBI. Utilizei esta sequência para um alinhamento local no BLASTp a fim de encontrar mais lectinas do mesmo gênero. Utilizei a ferramenta CLUSTAL para o alinhamento de todas as sequências e identifiquei as diferenças entre as proteínas do estudo.

Um software depende do resultado anterior para ser utilizado, se detenha nisso.

Nos resultados você irá novamente citar os programas utilizados e trazer o que encontrou. No geral é bastante objetivo, mas acaba por se tornar maior dependendo do número de softwares utilizados em cada etapa do trabalho.

Exemplo:

“Neste trabalho, trouxemos as primeiras estruturas tridimensionais das lectinas XP_018673705.1, XP_018673708.1, XP_009417126.1, todas pertencentes à M. acuminata ssp. Malaccensis. Na ferramenta BLASTp após o alinhamento local foram somente selecionadas as proteínas que obtiveram a maior identidade em relação a sequência de M. acuminata (PDB ID: 1X1V). As lectinas então selecionadas apresentaram 100% de cobertura com esta sequência, e identidades de XP_018673705.1 (96%), XP_018673708.1 (95%), XP_009417126.1 (91%). Na análise global do software CLUSTAL foi possível aferir que estas lectinas apresentam uma alta similaridade (aproximadamente 95%) e diferenças pontuais entre os sítios de ligação aos carboidratos.”

Na conclusão você deixará sucintamente explicado o que foi possível aferir conforme os últimos resultados (relacionando com o objetivo) e se serão necessários mais estudos e etapas.

Exemplo:

“Este estudo foi o primeiro a analisar as estruturas de três lectinas de Musa acuminata ssp. Malaccensis através de ferramentas bioinformáticas de alinhamento de sequências, modelagem e docking molecular. Embora as baixas energias de ligação, os aminoácidos do sítio de ligação a carboidratos estavam interagindo com a manose, demonstrando que essas moléculas têm potencial de ligação a este carboidrato.”

A conclusão se baseia nas últimas etapas do trabalho, no meu caso o docking molecular. Queríamos saber se a mudança de aminoácidos em sítios de ligações afetaria a interação da proteína com o substrato, podendo afetar a atividade biológica (objetivo).

É importante ainda, após a conclusão, você adicionar suas referências bibliográficas citadas ao longo do resumo.

Lembretes extras:

- Nomes estrangeiros, é interessante que estejam sempre em itálico assim como espécies de plantas, animais, bactérias…

- Não se esqueça de numerar suas figuras e tabelas para que possam ser citadas como (figura/tabela 1) ao longo do texto.

- Caso a imagem de algum resultado tenha estruturas em diferentes cores identifique cada uma.

Exemplo:

Resumindo essas dicas para vocês: