Chemistry with data magic – Medium

Chemistry with data magic

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化學資訊學入門：RDKit 基本操作 part 2 (3D分子結構、化學反應)

接著“化學資訊學入門：RDKit 基本操作 part 1 + 分子相似度計算”之後，我們繼續介紹一些 RDKit 常用的功能。

5d ago

化學資訊學入門：RDKit 基本操作 part 2 (3D分子結構、化學反應)

5d ago

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化學資訊學入門：RDKit 基本操作 part 1 + 分子相似度計算

RDKit是一個可以處理各種化學資訊的開源函式庫。我們會介紹如何使用 RDKit 來讀取分子、畫出結構圖、搜尋子結構…等基本操作。

Jul 13

化學資訊學入門：RDKit 基本操作 part 1 + 分子相似度計算

Jul 13

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化學資訊學入門與實作：PCA 與 PLS 的介紹與應用

克服線性回歸模型的弱點：主成分分析PCA、主成份回歸PCR、偏最小平方回歸PLS的介紹

Jul 6

化學資訊學入門與實作：PCA 與 PLS 的介紹與應用

Jul 6

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化學資訊學入門：如何處理化合物資訊？SMILES又是什麼？

將化合物結構轉換成 SMILES 字串是化學資訊學的基礎技術之一

Jun 29

化學資訊學入門：如何處理化合物資訊？SMILES又是什麼？

Jun 29

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化學資訊學入門與實作：Logistic regression (邏輯迴歸) 的介紹與應用

我們簡單介紹了邏輯回歸的基本概念。然後用 Ames 數據簡單地構築了 QSAR 分類模型

Jun 22

化學資訊學入門與實作：Logistic regression (邏輯迴歸) 的介紹與應用

Jun 22

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化學資訊學基礎：分子描述符 Mordred 的介紹與使用經驗談

分子描述符 Mordred 的內容整理與使用經驗談

Jun 16

化學資訊學基礎：分子描述符 Mordred 的介紹與使用經驗談

Jun 16

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化學資訊學小技巧：分子可視化工具 mols2grid

mols2grid是一個函式庫用來視覺化 sdf ，還可以在上面可以加自己需要的訊息。

Jun 9

化學資訊學小技巧：分子可視化工具 mols2grid

Jun 9

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化學資訊學入門與實作：決策樹 (Decision tree) 的介紹與應用

在 Ames 測試資料集上進行決策樹建模與結果可視化

Jun 2

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Jun 2

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化學資訊學基礎：分子指紋 MACCS Keys 的詳細介紹

MACCSkey 166種子結構的整理

May 28

化學資訊學基礎：分子指紋 MACCS Keys 的詳細介紹

May 28

Chemistry with data magic

化學資訊學入門與實作：線性回歸模型的介紹與應用（續篇）

配合一個QSPR的例子來解釋Elastic Net、交叉驗證和超參數調整

May 25

化學資訊學入門與實作：線性回歸模型的介紹與應用（續篇）

May 25

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I am working on improving material developments by creating machine learning analytical tools for chemical data to accelerate the material discovery.

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